การเรียนรู้เชิงลึกเปิดเผยว่าโปรตีนมีปฏิสัมพันธ์กันอย่างไร

ภาพจาก UW Medicine

กลุ่มนักวิจัยจากหลายสถาบันได้สร้างตัวแบบสามมิติของปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนในเซลล์ยูคาริโอต (eukaryotic cell) โดยใช้การวิเคราะห์เชิงวิวัฒนาการและการเรียนรู้เชิงลึก (deep learning) นักวิจัยวิเคราะห์ลำดับยีนที่รู้จักในยีสต์เพื่อทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์ที่สร้างโปรตีนเชิงซ้อน และใช้สถิติระบุคู่ของยีนที่กลายพันธุ์ตามธรรมชาติในลักษณะที่เชื่อมโยงกัน พวกเขายังใช้ซอฟต์แวร์ RoseTTAFold ของ UW Medicine และซอฟต์แวร์การเรียนรู้เชิงลึก AlphaFold ของ DeepMind เพื่อจำลองรูปร่าง 3 มิติของโปรตีนที่มีปฏิกิริยาระหว่างกัน David Baker แห่ง UW Medicine กล่าวว่างานวิจัยนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับปฏิกิริยาของโปรตีนสำหรับกระบวนการแกนกลางของเซลล์ยูคาริโอตเกือบทั้งหมด ซึ่งรวมถึง "ปฏิกิริยามากกว่า 100 ชนิดที่ไม่เคยเห็นมาก่อน"

อ่านข่าวเต็มได้ที่: UW Medicine