 |
| ภาพจาก Rice University News |
วิธีการ RAMBO (repeated and merged bloom filter) แบบใหม่ที่พัฒนาโดยนักวิทยาศาสตร์คอมพิวเตอร์จาก Rice University ที่ช่วยลดเวลาในการค้นหาจีโนมจากฐานข้อมูล DNA ขนาดใหญ่ได้อย่างมาก RAMBO สามารถลดเวลาในการจัดทำดัชนีสำหรับฐานข้อมูลเมตาเจโนมิก (metagenomic) จากสัปดาห์เป็นชั่วโมง และเวลาสืบค้นจากชั่วโมงเป็นวินาที โครงสร้างข้อมูลของ RAMBO รองรับการสืบค้นที่เร็วกว่าวิธีการสร้างดัชนีจีโนมที่ทันสมัยในปัจจุบัน และช่วยให้การทำงานแบบขนานทำได้ง่ายขึ้น ให้อัตราผลลบปลอม (false negative) เป็นศูนย์ และอัตราผลบวกปลอมที่ต่ำ Gaurav Gupta ของ Rice กล่าวว่า RAMBO ค้นหาฐานข้อมูล DNA ได้เร็วกว่าวิธีการปัจจุบัน 35 เท่า ในการทดลองกับชุดข้อมูลจีโนมจุลินทรีย์ 170-TB วิธีการนี้ลดเวลาการจัดทำดัชนีโดยใช้ (คอมพิวเตอร์) คลัสเตอร์เฉพาะจากหกสัปดาห์เป็นเก้าชั่วโมง
อ่านข่าวเต็มได้ที่: Rice University News
ไม่มีความคิดเห็น:
แสดงความคิดเห็น