วันพุธที่ 30 มีนาคม พ.ศ. 2565

Miniproteins ที่ออกแบบโดยซอฟต์แวร์สามารถสร้างกลุ่มยาใหม่ได้

software-designed-miniprotein
ภาพจาก Science

นักวิจัยจาก University of Washington (UW)ได้ออกแบบมินิแอนติบอดี (mini-antibody) โดยใช้ซอฟต์แวร์ Rosetta เพื่อทำนายการพับของโปรตีน (protein-folding) ซึ่งอาจนำไปสู่ยากลุ่มใหม่ นักวิจัยระบุตำแหน่งที่จับกับโปรตีนอย่างแน่นหนาและสร้างแอนติบอดีรอบตัวพวกมัน ด้วยซอฟต์แวร์ทำนายโครงสร้างโปรตีนตามลำดับกรดอะมิโนของพวกมัน

พวกเขาจับคู่ตำแหน่งที่เป็นไปได้ในการเชื่อมโดยสั่งให้โปรแกรมคำนวณว่ากรดอะมิโนจำเพาะจะจับกับจุดต่างๆ ทั่วพื้นผิวของโปรตีนเป้าหมายแน่นหนาแค่ไหน จากนั้นซอฟต์แวร์จึงค้นหาคลัสเตอร์ของตำแหน่งใกล้เคียงและค้นหาวิธีประกอบมินิโปรตีน (miniprotein)  ที่เสถียรซึ่งจะผูกกับตำแหน่งที่เป็นไปได้มากที่สุดในคลัสเตอร์ Longxing Cao แห่ง UW กล่าวว่าผลลัพธ์ที่ได้คือ "เราสามารถออกแบบโปรตีนเพื่อเชื่อมกับเป้าหมายใดก็ได้"

อ่านข่าวเต็มได้ที่: Science




ไม่มีความคิดเห็น:

แสดงความคิดเห็น